パンゲノム

汎ゲノムは全ての株が共有する「コアゲノム」遺伝子に至るまで、種内に存在する全ての遺伝子のスーパーセットである株のサブセットでのみ個別株では「不要ゲノム」または「ユニークな遺伝子」が存在します。次世代シーケンシングと最先端のアセンブリアルゴリズムは、汎ゲノムの構築が可能にマッピング作り、個人または複数の株のためのゲノムマップの構築は、集団レベルでの詳細な遺伝的多様性を調査するために前例のない機会を提供しています。

アプリケーションの例としては、野生と栽培株に望ましい形質の遺伝的基礎を識別するための育種研究、および異なるhabitats.Novogene全体の種の適応進化上の分子生態学研究を含む汎ゲノムのアセンブリと分析のパイオニアで、世界的リーダーでありますマップ。私たちの汎ゲノム研究の研究では、先頭の科学雑誌に掲載されている、と私たちは、同じ高品質なデータをお客様に提供し、分析します。

サービスの強み

Highly experienced: extensive experience in pan-genome assembly and analysis with publications in top-tier journals.

Cost effective: ess expensive than de novo sequencing, pan-genome allows the discovery of species-wide and strain-specific genes.

Comprehensive bioinformatics: eveals structural variations (SV), copy number variations (CNV), and presence/absence variations (PAV) that may be missed when only resequencing highly similar regions.

サービスの流れ

SEQUENCING STRATEGY: HiSeq X Ten platform, paired-end 150 bp

DATA QUALITY GUARANTEE: Simple genome: Contig N50 ≧ 10 Kb, Scaffold N50 ≧ 100 Kb; Complex genome: Contig N50 ≧ 10 Kb, Scaffold N50 ≧ 50 Kb

TURNAROUND TIME: Depending on the number of samples

RECOMMENDED SEQUENCING DEPTH: Simple genome: 50x; Complex genome: 100x

SAMPLE REQUIREMENTS: DNA amount: ≧ 400 μg