メタゲノムシーケンス

メタゲノミクスでは、環境サンプルからゲノムは、したがって、それは、幅広いアプリケーションで、彼らの自然の生息地で微生物群集を研究するための強力な技術で、前の分離および個々の種の栽培せずに分析し、されています。Novogeneでは、試料中に表さ種、遺伝子、および経路を特定するために、バイオインフォマティクスの専門知識の恩恵を受けながら、微生物群集の豊かな遺伝的レパートリーを探る手助けするNGSにおける当社の専門知識に頼ることができます。

NovogeneはイルミナHiSeqプラットフォームとアセンブリ-最初の戦略とメタゲノム配列決定を提供し、当社のバイオインフォマティクスは、遺伝子予測、機能注釈、分類学上の注釈を提供し分析します。当社の標準的な解析パッケージはMPATH、ヒートマップ、PCA、クラスタ分析およびその他のプログラム、生成する高品質、出版可能なデータが含まれます

サービスの強み

Highly experienced: We have completed over 400 metagenomic sequencing projects for our customers, and have published multiple metagenomic studies

Outstanding service: We provide high-quality sequencing, an efficient standard workflow, and bioinformatics analyses at a cost-effective price.

Effective methodology: Our techniques enhance the generation of data from low-abundance species

Comprehensive analysis: Expert bioinformatics analysis with three databases (KEGG, eggNOG, CAZy) provides comprehensive data on annotated genes and metabolic pathways.

サービスの流れ

SEQUENCING STRATEGY: 300-bp insert DNA library; HiSeq platform, paired-end 150 bp

DATA QUALITY GUARANTEE: Each sample generates at least 5-10 Gb raw data, with Q30 ≧ 80%.

TURNAROUND TIME: Within 15 working days from verification of sample quality (without data analysis); Additional 10 working days for data analysis

RECOMMENDED SEQUENCING DEPTH: Two strategies: 5 Gb raw data or 10 Gb raw data

SAMPLE REQUIREMENTS: DNA amount: ≧ 1 μg (for one library preparation); DNA concentration: ≧ 20 ng/μ; Purity: OD260/280 = 1.8 - 2.0 without degradation or RNA contamination