アンプリコン（16S/18S/ITS）シーケンス

アンプリコン（16S/18S/ITS）シーケンスは微生物種を同定・分類するための手法として、広く用いられています。保存遺伝子や遺伝子間領域の高度可変領域をPCRで増幅した後に、次世代シーケンスで解析し、その結果を微生物のデータベースと比較します。

細菌や古細菌において、16S rRNAは菌種同定に最も利用される領域です。真菌に関しては、18S rRNAおよびrRNA 間の2つのITS 領域の3つの領域がよく用いられます。通常これらの領域は近縁種の分類するのに充分な特異性を持ち、時に亜種も区別できます。

Novogeneでは5万以上の微生物検体をシーケンスした経験があります。Novogeneのパッケージデータ解析には、α多様性解析、OTU解析、生物名アノテーション、β多様性解析および多変量解析が含まれます。また、アンプリコン（16S/18S/ITS）シーケンスは純粋培養の単一菌種同定や動物と植物の細菌叢調査、環境・地域の種多様性・集団構造の比較など、豊富なアプリケーションに対応しています。Novogeneのスペシャリストはお客様の研究に合わせた適切な解析方法を提案いたします。

サービスの強み

豊富な経験: 5万以上の微生物検体をシーケンスし、20部以上の関連論文を発表しました。

優れたサービス: Qリーズナブルな価格で高品質のシーケンス、効率的なワークフロー、短期間の納期と専門家によるデータ解析を含むサービスを提供します。

有効な増幅方法: 当社の増幅方法は95%以上の成功率を誇ります。PCRフリーライブラリーは増幅バイアスを回避できます。

包括的なデータ解析: 最新のデータベースやソフトを利用した専門性の高いデータ解析を提供します。高品質で、論文作製に適した結果を提供します。

サービスの流れ

シーケンス条件: 130-470 bpインサートDNAライブラリー; HiSeq PE250

推薦データ量: データ量は30,000 tags、50,000 tags、100,000 tagsなどお選びいただけます。

納期: （データ解析を含まない場合）検体品質検定合格後、最短15営業日。; （データ解析を含む場合）11営業日追加。

検体要件: DNAの量 ≧ 150 ng; DNAの濃度 ≧ 20 ng/μl; OD260/280 = 1.8 － 2.0; RNAのコンタミネーションがないこと; 増幅断片長が450bp以下