mRNA-seq解析

mRNA-Seq解析はディープシーケンスの技術に基づくトランスクリプトームを網羅的に解析する方法です。マイクロアレイ解析のような他の方法より正確に転写レベルとアイソフォームを解析でき、コーディングトランスクリプトームの完全なスナップショットが得られます。

トランスクリプトームシーケンスは長いリード長で新規転写産物、選択的スプライシングと融合遺伝子を同定します。研究者はバイオマーカーや異なる表現型を決定する調節遺伝子、機能遺伝子、または一時的な発現変化のキーファクターを同定できます。RNA-Seq定量化は短いリード長で多くの転写産物の発現レベルを同時に測定でき、疾患研究、薬物反応、薬物動態学、オーダーメイド医療などに広く活用されています。

当社は、最先端のイルミナシーケンサーを用いて包括的なトランスクリプトームシーケンスとRNA-Seq定量化のサービスを提供します。研究目的によって、様々なシーケンス条件や実績豊富な解析ソフトウェアで解析します

サービスの強み

30,000以上の検体をシーケンスし、3,000以上のプロジェクトを完了した豊富な実績があり、様々な種のトランスクリプトームシーケンス結果を科学誌で発表しています。
Q30 ≧ 80%の高品質データはイルミナ社のオフィシャルガイドラインを上回ります。
実績豊富なメインストリームのソフトウェアを使用し、包括的なデータ分析と確立された社内工程で新しい転写産物、発現の量的差異と機能情報を見つけ出します。
ノヴォジェンの顧客は無料で強力なソフトウェアNovofinderが使用できます。システムに実装されているインターフェースは洗練されており、解析結果と機能情報のデータが見やすいように視覚化されています。

サービスの流れ

シーケンス条件: 250~300bp cDNAライブラリー; HiSeq 150bpペアエンド(トランスクリプトームシーケンス); HiSeq 50bpシングルエンド(RNA-Seq定量化)

データ品質保証: データの品質を保証します。当社のQ30(PE150 ≧ 80%、SE50 ≧ 85%)はイルミナ社のオフィシャルガイドライン(PE150 ≧ 75%、SE50 ≧ 80%)を上回ります。

納期: （データ解析を含まない場合）RNA品質検定合格後、最短15営業日。; （データ解析を含む場合）プロジェクトによって異なります。

推奨するデータ量の目安: 6Gb／検体（2000万リードペア／検体）

検体要件: Total RNA 1.5 μg以上（50 ng/μl以上）。; 植物と真菌の検体RIN ≧ 6.3、動物の検体RIN ≧ 6.8。; OD260/280 ≧ 2.0、OD260/230 ≧ 2.0、RNAの分解とDNAのコンタミネーションがないこと。; 検体送付の前に電気泳動でRNAの量をご確認ください。