ジェノタイピングシーケンス

ジェノタイピング・バイ・シークエンシング（GBS）は、SNPのか、他のマーカーの多数のマッピングを介して遺伝子型を比較するための迅速かつ費用対効果の高いアプローチです。 GBSは大きなゲノムに適用することができるように、制限酵素消化ステップは、ゲノムの複雑さを低減し、端部がフラグメントは全く参照ゲノムが利用できないときに変異体が比較されることを可能にする制限を読み出します。

GBSのアプリケーションでは、自然集団、新たな遺伝子マーカーの発見の多様性を検討し、育種プログラムと保全プロジェクトに植物や動物の遺伝子型を追跡含まれ、およびスクリーニングは、全ゲノム再配列決定の前に変異体です。

GBSとWGSの両方を提供し、プロジェクトと予算の目標のための最善の方法をアドバイスすることができます。 GBSは、WGS未満の配列データを提供し、より多くは、費用対効果のいくつかの用途のために非常に正確であり、参照ゲノムの非存在下で使用することができるです。参照ゲノムが利用可能な場合、WGSは、より包括的な比較のために推奨されます。

サービスの強み

Leader in NGS services: We provide high-quality sequencing, an efficient standard workflow, fast turnaround time, and bioinformatics analyses at a cost-effective price.

High quality data: We guarantee that ≧ 80% of bases have a quality score above Q30, exceeding Illumina’s official guarantee of ≧ 75%.

Verification rate of SNPs: e promise that the verification rate of SNPs is higher than 90%.

サービスの流れ

SEQUENCING STRATEGY: 350-400 bp insertion DNA library; HiSeq platform, paired-end 150 bp

DATA QUALITY GUARANTEE: Novogene guarantees its data quality and output. Our data quality guarantee, as measured by the percentage of bases with a sequencing quality score above Q30 (PE150, ≧ 80%), exceeds Illumina’s official guarantee (PE150, ≧ 75%).

SAMPLE REQUIREMENTS: DNA amount: ≧ 600 ng (for two library preparation, quantified by Qubit 2.0); Total volume: ≧ 10 μl; Purity: OD260/280 = 1.8-2.0 without degradation and RNA contamination

TURNAROUND TIME: Within 15 working days from verification of sample quality (without data analysis); 10 additional working days for data analysis

RECOMMENDED SEQUENCING DEPTH: Tags ≧ 100,000, 8X/Tag on average